Nel 1162 il re di Castiglia Alfonso VII, per un voto, chiamò alcuni monaci francesi provenienti da Verduns in Guascogna dell'Ordine Cistercense di
stretta osservanza che si attenevano alla regola stabilita da san Benedetto nel VI secolo e li alloggiò a Cantavos l'attuale Fuentelmonge a 15 km da Huerta in una fattoria che si rivelò insufficiente e scarsa d'acqua per la comunità monacale che nel frattempo aumentava di numero.
A partire dal 1179 s'iniziò a costruire il grande monastero ad opera di Alfonso VIII il Nobile in una località ricca d'acqua vicino al fiume Jalon.
Nel corso dei secoli il Monastero crebbe in potere e ricchezza e fu sempre abitato dai monaci fino al 1835 quando intervenne la legge che va sotto il nome di Desamortización decisa da Juan Álvarez Mendizábal e i monaci furono costretti ad abbandonare il monastero.
Juan Álvarez Mendizábal (1790-1853) fu un uomo politico ed economista capo del governo spagnolo nel 1835-1836 che fece l'importante riforma della Desamortización che, nonostante il breve periodo di vita del suo governo, esercitò un notevole influsso sull'evoluzione della società spagnola nel XIX secolo e in quello successivo.
Con questa legge si aboliva la cosiddetta manomorta termine col quale s'indicava nel diritto medievale il complesso dei beni immobiliari sottratti all'alienazione e non sottoposti a tasse successorie, perché appartenenti ad enti o fondazioni, di solito della Chiesa o di ordini religiosi.
Questi beni vennero espropriati, lottizzati e venduti all'asta. Lo scopo di questa operazione, nelle intenzioni di Mendizábal era quello di favorire la nascita di un ceto medio borghese che in Spagna non si era ancora formato a differenza del resto d'Europa.
La legge non realizzò quest'intento e favorì il latifondismo perché nobili o ricchi borghesi riuscirono molto spesso ad aggiudicarsi le aste.
Il monastero di Huerta, abbandonato, rischiò di andare in rovina, ma per fortuna vi fu uno studioso d'arte e di storia che intervenne affinché si provvedesse alla sua conservazione e che nel 1882 fosse dichiarato monumento nazionale.
Per quasi un secolo il Monastero non ebbe più monaci, dei quali ritornò un piccolo nucleo nel 1930 proveniente dal monastero cantabrico di Vinceli.
Attualmente la comunità è formata da una ventina di monaci che hanno favorito anche il nascere di una comunità di laici che si appoggiano al monastero ed esercitano una funzione culturale ospitando convegni, conferenze, concerti e vivono del loro lavoro secondo le prescrizioni dell'Ordine: ora et labora.
La Chiesa ha la facciata originaria romanico-gotica, l'interno è stato completamente barrocchizzato nel XVII secolo e contiene le tombe dei duchi di Medinaceli.
Il Refettorio è un grande ambiente gotico del 1215, a volta, con un rosone e un pulpito cui si accede mediante una bella scala. Accanto c'è l'antica cucina.
Il Chiostro dei cavalieri, il cui nome deriva dalla consuetudine nei tempi passati di seppellirvi nobili o persone importanti, è un bel chiostro a due piani quello inferiore gotico del XIII secolo; il piano superiore è del 1531 con decorazioni plateresche molto ricche che rappresentano diversi temi ed eventi: scene bibliche e della scoperta dell'America, ritratti di santi, di abati, di re di Castiglia.